• Ректорат НовГУ
• Военный учебный центр
• Ассоциация выпускников НовГУ  
• Отдел стратегического развития 
• Центр творческой интеллигенции имени В.В.Сороки
• Высшая гуманитарная школа "Антоново"
     - НОЦ "Гуманитарная урбанистика"
• Мобилизационный отдел
• Центр исследования проблем микропластика 

2. Проректор по образовательной деятельности:

• Заместитель проректора по образовательной деятельности
• Многофункциональный центр обучающихся (МФЦО)
  
• Управление образовательных программ    

• Управление развития компетенций    
  

• Заместитель проректора
• Инжиниринговый центр "Радиоэлектронного прототипирования"
      - Конструкторско-технологический отдел
      - Научно-исследовательский отдел
      - Отдел метрологии
      - Отдел технического контроля
      - Производственный отдел
• Научно-исследовательский центр 
     - Научные группы 
    - Служба качества
• Отдел аспирантуры и молодежной науки 
• Центр "Геномного инжиниринга" 
     - Лаборатория "Биобанк, геномный инжиниринг" 
     - Отдел молекулярно-генетических исследований 
• Центр "Междисциплинарных исследований и разработок"
     - Лаборатория "Медицинской информатики"   
     - Лаборатория "Нейротехнологий"
     - Лаборатория "Прототипирования"
     - Лаборатория "Робототехники и мехатроники"
  
• Центр развития публикационной активности НовГУ 
     - Отдел мониторинга и индексирования 
     - Отдел сопровождения конференционной активности 
     - Редакционно-издательский отдел 

• Контактная служба
     - Отдел маркетинга, планирования и отчетности
     - Отдел размещения заказов
• Медицинский центр 
     - Амбулаторно-поликлиническое отделение 
     - Санаторий-профилакторий НовГУ  
• Управление бухгалтерского учета 
    - Отдел материального учета 
    - Расчетный отдел 
    - Финансовый отдел 
    - Отдел бухгалтерской отчетности и финансового контроля

• Учебно-клинический стоматологический центр 
• Финансово-экономическое управление 
•    - Отдел сводного планирования и анализа
     - Отдел штатного расписания и бюджетных ассигнований
• Центр общественного питания 
     - Кафе НовГУ 
     - Столовая ИГУМ
     - Столовая ИБХИ 
     - Столовая НовГУ 
     - Столовая Института цифровой экономики, управления и сервиса
     - Столовая ИМО 
     - Столовая Политехнического колледжа 
• Центр профессионального образования "Водитель плюс" 
     - Отдел методического и психологического обеспечения подготовки водителей
     - Отдел по подготовке водителей автотранспортных средств(автомобилей)
     - Отдел производственного обучения вождению
     - Отдел технического обслуживания и ремонта 
        - Автомастерская 
  
• Юридическое управление 
     - Правовой отдел 
• Управление по работе с персоналом 
     - Отдел документационного обеспечения 
        - Архив 
     - Отдел кадров 
     - Служба охраны труда 
     - Центр обучения и повышения квалификации по охране труда 

5. Проректор по молодежной политике

• Управление молодежной политики 
     - Гражданско-патриотический клуб "Сердце помнит"
     - Психологическая служба
     - Центр карьеры 
     - Центр оценки и развития надпрофессиональных компетенций
     - Центр физического развития и спорта

• Управление воспитательной деятельности

6. Проректор по развитию кампуса

• Административно-хозяйственное управление
 - Отдел общежитий
 - Отдел по строительству и ремонту зданий и сооружений
 - Транспортный отдел
 - Учебно-оздоровительный центр 
 - Отдел снабжения
 - Хозяйственный отдел
    

• Отдел по управлению имущественным комплексом
• Главный инженер 
•  Инженерно-производственный отдел

• Музей истории НовГУ

• Лаборатория нейротехнологий и мехатроники

• Передовая инженерная школа "Распределенные системы управления технологическими процессами"

•  - Отдел гражданской обороны и чрезвычайных ситуаций
  
  
• Управление цифрового развития
  - Центр новых информационных технологий
      - Отдел обеспечения информационной безопасности
      - Отдел обслуживания и ремонта средств вычислительной и копировальной техники
      - Отдел сетевых технологий
      - Отдел телекоммуникаций и систем связи
  
  - Центр цифровых систем управления
      - Отдел бухгалтерско-финансовых СУБД
      - Отдел внедрения цифровых систем управления университетом
      - Отдел технического и мультимедийного сопровождения
      - Отдел цифровых технологий управления университетом 

Институт биотехнологий и химического инжиниринга
 - Дирекция Института биотехнологий и химического инжиниринга 
      - Отдел обеспечения деятельности 
      - Естественнонаучный музей ИБХИ
      -  Кафедра биологии и биоинформатики 
      -  Кафедра биологии, биохимии и биотехнологий
      - Кафедра геоэкологии и лесоустройства  
      -  Кафедра технологии производства и переработки с/х продукции  
      -  Кафедра фундаментальной и прикладной химии 
      - Учебно-научная исследовательская лаборатория ИБХИ
          - Сектор биохимии и биомедицины
          - Сектор пищевого производства и сельскохозяйственной продукции
          - Сектор прикладной биотехнологии
          - Сектор фундаментальной и прикладной химии
      -  Центр дополнительного профессионального образования и повышения квалификации 

- Отделение среднего профессионального образования в структуре института биотехнологий и химического инжиниринга

 Институт медицинского образования
  - Дирекция Института медицинского образования 
      - Аккредитационно-симуляционный центр 
      - Отдел обеспечения деятельности 
      - Кафедра акушерства,гинекологии и педиатрии 
      - Кафедра внутренних болезней 
      - Кафедра восстановительной медицины и остеопатии 
      - Кафедра госпитальной хирургии 
      - Кафедра дополнительного образования по стоматологическим специальностям 
      - Кафедра дополнительного профессионального образования и поликлинической терапии 
      - Кафедра микробиологии, иммунологии и инфекционных болезней
      - Кафедра морфологии человека 
      - Кафедра неврологии и психиатрии 
      - Кафедра нормальной физиологии 
      - Кафедра общей патологии 
      - Кафедра общественного здоровья, здравоохранения и общей гигиены 
      - Кафедра сестринского дела 
      - Кафедра специализированной терапии 
      - Кафедра стоматологии 
      - Кафедра фармации 

- Кафедра педиатрии

- Центр учебно-вспомогательного персонала

      - Учебно-научный центр функциональных и эпидемиологических методов исследования 
      -  Центр "Повышения квалификации фармацевтических специалистов" 
     - Центр международного сотрудничества ИМО
   - Медицинский колледж 

- Отдел ординатуры и непрерывного медицинского образования

 Политехнический институт

• Дирекция Политехнического института

• Дирекция института электронных и информационных технологий